1931年“九·一八”事变爆发后，刘曼卿积极投入抗日宣传，发动藏区民众“襄助以共赴国难”。1938年，她担任行政院中央慰问宣传团团长再赴西藏，号召西藏各界支持抗日、参与抗日。

　　为让国人了解西藏，她编撰出版《边疆教育》、《西藏》(小学生文库)等书籍，以及介绍西藏的文章。她还时常到大学、报馆作主题演讲，强调爱国报国，反对分裂西藏。

　　1942年9月29日，刘曼卿在重庆郊外病逝，享年36岁。